JSCo jest oficjalnym i długotrwałym partnerem biznesowym krakowskiej firmy Comarch, która zajmuje się tworzeniem specjalistycznego oprogramowania przeznaczonego dla wymagających przedsiębiorców. Bardzo popularnym produktem znajdującym się w sprzedaży spółki JSCo jest aplikacja Comarch Optima, która przydatna jest przede wszystkim zakładom produkcyjnym, ale nie tylko im - wspomagają one procesy płacowe i kadrowe, dlatego z powodzeniem mogą być stosowane wszędzie, także w biurach rachunkowych. Systemu z grupy Comarch Optima zbudowane są z kilkunastu odrębnych modułów, które dotyczą konkretnych obszarów działalności pracowniczej, między innymi księgowości czy prac magazynowych. Każdy sektor może korzystać ze swojej części, ale program jest jeden.